integrat sergio
This commit is contained in:
+162
-45
@@ -90,13 +90,9 @@ container: SOMA
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tub_local:
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- VDB
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- Na
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- Ca2+
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- RefractorySoma
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tub_intricated:
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@@ -128,10 +124,26 @@ check_tpc: VDB-Concentration
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||||
out_tpc: VDBLowCtx
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||||
```
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||||
#### SomaSpill: interacting
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||||
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||||
```Gen
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||||
interacting: SomaSpill
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||||
contained_by: SOMA
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||||
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||||
context: any
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rf: ( active: 8x )
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||||
hypothesis: NOT NA emptiness
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action: [ decrease NA ]
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trace:
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```
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#### SomaSpike: check_tpc
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||||
Qui siamo nella fase effettiva di spike, non refractory che viene dopo. Fa da contesto di durata fra un RF ed un altro.
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||||
La fullness di Na rappresenta il threshold e puo' essere modificato. La fullness di RefractorySoma rappresenta la lunghezza del refractory.
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```Gen
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check_tpc: SomaSpike
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||||
contained_by: SOMA
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||||
@@ -139,7 +151,7 @@ check_tpc: SomaSpike
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||||
context: fixed
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||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
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||||
condition: ( Na fullness ) AND ( NOT SomaRefractoryCtx )
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||||
condition: ( Na fullness ) AND ( RefractorySoma emptiness )
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||||
out_context: ApCtx
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||||
out_context: bApCtx
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||||
```
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||||
@@ -168,14 +180,16 @@ interacting: ApBeh
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||||
trace:
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```
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#### RefractoryBeh: interacting
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||||
#### RefractorySpill: interacting
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||||
Lo spill deve essere piu' lento dell'increase che avviene in APBeh
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```Gen
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interacting: RefractoryBeh
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||||
interacting: RefractorySpill
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||||
contained_by: SOMA
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||||
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||||
context: any
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||||
rf: ( active: 8x )
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||||
rf: ( active: 16x )
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||||
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||||
hypothesis: NOT RefractorySoma empty
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||||
action: [ decrease RefractorySoma ]
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||||
@@ -240,105 +254,208 @@ container: VGSC-SOMA-H
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||||
tub_local:
|
||||
Ready ( )
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||||
tub_local:
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||||
RefractoryH ( full: 60x, active: 30x, empty: 0x )
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||||
tub_intricated:
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||||
Na ( contained_in: SOMA)
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||||
```
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||||
### sec: VGSC-SOMA-H
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||||
#### VGSC-H_TPC: check_tpc
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||||
Il check su refractory deve essere fatto ad un RF maggiore della eliminazione di Refractory. Questo perche' e' un era nella qualle avviene l'episodio.
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||||
```Gen
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||||
check_tpc: VGSC-H_TPC
|
||||
contained_by: VGSC-SOMA-H
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||||
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||||
tpc: VDBMaxCtx
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||||
rf: ( active: 60x )
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||||
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||||
condition: ( RefractoryH emptiness )
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||||
out_context: NaEnterH_Ctx
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||||
```
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||||
#### NaEnterH: interacting
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||||
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||||
Se metto il controllo sulla (NOT Ready fullness) il VGSC puo' far entrare un numero di Na non superiore ad un massimo.
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||||
Questo sopra è il commmento della versione precedente, ora la quantità di NA increase dipende dal rf di VGSC-H_TPC dato che li c'è la condition sulla presenza delle traccie di refractory
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||||
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||||
```Gen
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||||
interacting: NaEnterH
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||||
contained_by: VGSC-H-SOMA
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||||
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||||
context: VDBMaxCtx AND ( NOT RefractoryH )
|
||||
context: NaEnterH_Ctx
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||||
rf: ( active: 1x )
|
||||
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||||
hypothesis: ( NOT Na fullness ) AND ( NOT ReadyH fullness )
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||||
action: [ Na increase, ReadyH increase ]
|
||||
hypothesis: ( NOT Na full )
|
||||
action: [ Na increase]
|
||||
trace: None
|
||||
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||||
hypothesis: ( NOT RefractoryH full )
|
||||
action: [ RefractoryH increase ]
|
||||
trace: None
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||||
```
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||||
##### CheckRefractoryH: check_tpc
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||||
##### RefractoryHSpill: interacting
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||||
Il check su refractory deve essere fatto ad un RF maggiore della eliminazione di Refractory. Questo perche' e' un era nella qualle avviene l'episodio.
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||||
Lo Spill deve avere un rf maggiore dell'interacting che incrementa RefractoryH (interactor precedente)
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||||
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||||
```Gen
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||||
check_tpc: CheckRefractoryH
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||||
interacting: RefractoryHSpill
|
||||
contained_by: VGSC-H-SOMA
|
||||
|
||||
context: NOT RefractoryH
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||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition: ( ReadyH fullness )
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||||
out_context: RefractoryH
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||||
```
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||||
##### RefractoryH: interacting
|
||||
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||||
Questo episodio deve girare varie volte nell'ambito del contesto di refractory che viene controllato ad un RF maggiore.
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||||
```Gen
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||||
interacting: RefractoryH
|
||||
contained_by: VGSC-H-SOMA
|
||||
|
||||
context: RefractoryH
|
||||
context: any
|
||||
rf: ( active: 1x )
|
||||
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||||
hypothesis: NOT ( ReadyH emptyness )
|
||||
action: [ ReadyH decrease ]
|
||||
hypothesis: NOT ( RefractoryH empty )
|
||||
action: [ RefractoryH decrease ]
|
||||
trace: None
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||||
```
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||||
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||||
## VGSC-SOMA-M: container
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|
||||
Voltage Gated Sodium Channel
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||||
Voltage Gated Sodium Channel: less difficult to open (Medium)
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||||
```Gen
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||||
container: VGSC-SOMA-M
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||||
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||||
tub_local:
|
||||
Ready ( )
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||||
tub_local:
|
||||
RefractoryM ( full: 60x, active: 30x, empty: 0x )
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||||
tub_intricated:
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||||
Na ( contained_in: SOMA)
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||||
```
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||||
### sec: VGSC-SOMA-M
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||||
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||||
#### interacting2
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||||
#### VGSC-M_TPC: check_tpc
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||||
|
||||
Il check su refractory deve essere fatto ad un RF maggiore della eliminazione di Refractory. Questo perche' e' un era nella qualle avviene l'episodio.
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||||
|
||||
```Gen
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||||
interacting: ??
|
||||
check_tpc: VGSC-M_TPC
|
||||
contained_by: VGSC-SOMA-M
|
||||
|
||||
tpc: VDBMediumCtx OR VDBMaxCtx
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition: ( RefractoryH emptiness )
|
||||
out_context: NaEnterM_Ctx
|
||||
```
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||||
#### NaEnterM: interacting
|
||||
|
||||
Se metto il controllo sulla (NOT Ready fullness) il VGSC puo' far entrare un numero di Na non superiore ad un massimo.
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||||
Questo sopra è il commmento della versione precedente, ora la quantità di NA increase dipende dal rf di VGSC-H_TPC dato che li c'è la condition sulla presenza delle traccie di refractory
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||||
|
||||
```Gen
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||||
interacting: NaEnterM
|
||||
contained_by: VGSC-M-SOMA
|
||||
|
||||
context: xxx
|
||||
context: NaEnterM_Ctx
|
||||
rf: ( active: 1x )
|
||||
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
hypothesis: ( NOT Na full )
|
||||
action: [ Na increase]
|
||||
trace: None
|
||||
|
||||
hypothesis: ( NOT RefractoryM full )
|
||||
action: [ RefractoryH increase ]
|
||||
trace: None
|
||||
```
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||||
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||||
##### RefractoryMSpill: interacting
|
||||
|
||||
Lo Spill deve avere un rf maggiore dell'interacting che incrementa RefractoryH (interactor precedente)
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||||
```Gen
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||||
interacting: RefractoryMSpill
|
||||
contained_by: VGSC-M-SOMA
|
||||
|
||||
context: any
|
||||
rf: ( active: 1x )
|
||||
|
||||
hypothesis: NOT ( RefractoryM empty )
|
||||
action: [ RefractoryM decrease ]
|
||||
trace: None
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||||
```
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||||
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||||
## VGSC-SOMA-L: container
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||||
|
||||
Voltage Gated Sodium Channel
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||||
Voltage Gated Sodium Channel: easy to open (Low)
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
container: VGSC-SOMA-M
|
||||
container: VGSC-SOMA-L
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
Ready ( )
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
RefractoryL ( full: 60x, active: 30x, empty: 0x )
|
||||
|
||||
tub_intricated:
|
||||
Na ( contained_in: SOMA)
|
||||
|
||||
```
|
||||
|
||||
### sec: VGSC-SOMA-L
|
||||
|
||||
#### interacting3
|
||||
#### VGSC-L_TPC: check_tpc
|
||||
|
||||
Il check su refractory deve essere fatto ad un RF maggiore della eliminazione di Refractory. Questo perche' e' un era nella qualle avviene l'episodio.
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
interacting: ??
|
||||
check_tpc: VGSC-L_TPC
|
||||
contained_by: VGSC-SOMA-L
|
||||
|
||||
tpc: VDBLowCtx OR VDBMediumCtx OR VDBMaxCtx
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition: ( RefractoryH emptiness )
|
||||
out_context: NaEnterL_Ctx
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### NaEnterL: interacting
|
||||
|
||||
Se metto il controllo sulla (NOT Ready fullness) il VGSC puo' far entrare un numero di Na non superiore ad un massimo.
|
||||
Questo sopra è il commmento della versione precedente, ora la quantità di NA increase dipende dal rf di VGSC-H_TPC dato che li c'è la condition sulla presenza delle traccie di refractory
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
interacting: NaEnterL
|
||||
contained_by: VGSC-L-SOMA
|
||||
|
||||
context: xxx
|
||||
context: NaEnterL_Ctx
|
||||
rf: ( active: 1x )
|
||||
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
hypothesis: ( NOT Na full )
|
||||
action: [ Na increase]
|
||||
trace: None
|
||||
|
||||
hypothesis: ( NOT RefractoryL full )
|
||||
action: [ RefractoryL increase ]
|
||||
trace: None
|
||||
```
|
||||
|
||||
##### RefractoryLSpill: interacting
|
||||
|
||||
Lo Spill deve avere un rf maggiore dell'interacting che incrementa RefractoryH (interactor precedente)
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
interacting: RefractoryLSpill
|
||||
contained_by: VGSC-L-SOMA
|
||||
|
||||
context: any
|
||||
rf: ( active: 1x )
|
||||
|
||||
hypothesis: NOT ( RefractoryL empty )
|
||||
action: [ RefractoryL decrease ]
|
||||
trace: None
|
||||
```
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