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neuron/presynapse.md

@@ -228,8 +228,6 @@ PRESYNAPSE
 
 ### AP_ctx: PRESYNAPSE
 
-#### NTreleaseLow: int: ms
-
 Il rilascio di NT lo facciamo nel contesto di AP. Biologicamente dovrebbe avvenire solo in base alle concentrazioni, quindi anche al difuori degli AP.
 
 RF di interacting deve essere MOLTO piu' basso di un RF di AP. In maniera da essere attivo varie volte nel contesto di un episodio di AP. Il che ha senso perche' un AP e' SOMA ad un tempo piu' alto che i comportamenti di PRE. Questo poi per permettere la diversa contestualizzazione degli episodi di NTrelease, a piu' o meno alta velocita'.
@@ -246,7 +244,7 @@ NT empty. Qui siamo contestualizzati se Ca2+ full, il che dovrebbe significare i
 
 In tutti i casi di NT
 
-#### NTreleaseMedium: accumulator
+#### NTreleaseLow: accumulator
 ```Gen
 NTreleaseLow: ( active: 12x ) # Low
   type: accumulator
@@ -259,9 +257,6 @@ NTreleaseLow: ( active: 12x ) # Low
 ```
 
 #### NTreleaseMedium: accumulatorv
-
-In tutti i casi di NT
-
 ```Gen
 NTreleaseMedium: ( active: 9x ) # Medium
   type: accumulator
@@ -276,7 +271,6 @@ NTreleaseMedium: ( active: 9x ) # Medium
 ```
 
 #### NTreleaseHigh: accumulator
-
 ```Gen
 NTreleaseHigh: ( active: 3x ) # High
   type: accumulator
@@ -302,6 +296,7 @@ Serve a:
 
 ---
 
+#### Ca2+TracesAccumulationLow: accumulator
 ```Gen
 Ca2+TracesAccumulationLow: ( active: 10x )
   type: accumulator
@@ -314,7 +309,6 @@ Ca2+TracesAccumulationLow: ( active: 10x )
 ```
 
 #### Ca2+TracesAccumulationMedium: accumulator
-
 ```Gen
 Ca2+TracesAccumulationMedium: ( active: 6x ) # medium
   type: accumulator
@@ -327,8 +321,6 @@ Ca2+TracesAccumulationMedium: ( active: 6x ) # medium
 ```
 
 #### Ca2+TracesAccumulationHigh: accumulator
-
-
 ```Gen
 Ca2+TracesAccumulationHigh: ( active: 10x ) # high
   type: accumulator
@@ -348,6 +340,7 @@ eCB dipende da POST. Tende a modulare l'entrata di Ca2+ degli VGCC.
 
 Qui non facciamo un flush di eCB, riduciamo ogni mezzo secondo (context) di un RF di questo episodio.
 
+#### eCBClearance: accumulator
 ```Gen
 eCBClearance: ( active: 24x ) # Slow
   type: accumulator
@@ -380,7 +373,7 @@ RPShuttleLow: ( active: 48x ) # Low
       trace: None
 ```
 
-#### RPShuttleMedium: accumulatorv
+#### RPShuttleMedium: accumulator
 
 The "Sub-Optimal" State. The machinery is working, but it's held back by partial limitations. This covers cases where the signal is steady but the "piston" isn't firing at full speed, or where a high vacancy in the RRP (emptiness) forces a low signal to work a bit harder.
 
@@ -494,8 +487,6 @@ VGCC-PRE
 
 Da rivedere le condizioni per aggiungere mGluR che ha come proxy NT concentration!!!!!
 
-#### Ca2+enterLow: accumulator
-
 Here we comprehend the breaking activity on VGCC by: CDI, eCB and mGluR:
 
 ![breaking-cases.png](.attachments/breaking-cases.png)
@@ -514,6 +505,7 @@ Qui semplifichiamo:
 
 Devo controllare che le condizioni sotto siano esaustive. Qui ho confuso high con low, e inoltre ho messo NT per mGluR che devo controllare che abbia senso.
 
+#### Ca2+enterLow: accumulator
 ```Gen
 Ca2+enterLow: ( active: 12x ) # Low
   type: accumulator
@@ -526,7 +518,6 @@ Ca2+enterLow: ( active: 12x ) # Low
 ```
 
 #### Ca2+enterMedium: accumulator
-
 ```Gen
 Ca2+enterMedium: ( active: 6x ) # Medium
   type: accumulator
@@ -541,7 +532,6 @@ Ca2+enterMedium: ( active: 6x ) # Medium
 ```
 
 #### Ca2+enterHigh: accumulator
-
 ```Gen
 Ca2+enterHigh: ( active: 3x ) # High
   type: accumulator
@@ -556,8 +546,6 @@ Ca2+enterHigh: ( active: 3x ) # High
 
 ### NOT AP_ctx: VGCC-PRE
 
-#### Ca2+ClearanceLow: accumulator
-
 Qui eliminiamo Ca2+. Il tempo che ci mette ad eliminare il Ca2+ dovrebbe essere minoe dell'inervallo fra un AP_ctx e un'altra. Siccome non comprendiamo per ora ATP, non c'e' accumulo di Ca2+ per mancanza di ATP (stanchezza).
 
 Non non comprendiamo anche il ristabilimento del Voltage, con altri Ioni entranti e uscenti, per ora tutto dipende da AP del SOMA. Non comprendiamo per ora:
@@ -570,6 +558,7 @@ Qui disinguiamo:
 - NOT ca2+ fullness che svuota piu' lentamente
 - da capire se serve veramente questa distinzione per il tempo di svuotamento.
 
+#### Ca2+ClearanceLow: accumulator
 ```Gen
 Ca2+ClearanceLow: ( active: 24x ) # Low
   type: accumulator
@@ -582,7 +571,6 @@ Ca2+ClearanceLow: ( active: 24x ) # Low
 ```
 
 #### Ca2+ClearanceHigh: accumulator
-
 ```Gen
 Ca2+ClearanceHigh: ( active: 4x ) # High
   type: accumulator
@@ -595,7 +583,6 @@ Ca2+ClearanceHigh: ( active: 4x ) # High
 ```
 
 ## VGCC-PRE-TUN: Tuner
-
 ```Gen
 VGCC-PRE-TUN
   type: tuner
@@ -618,9 +605,7 @@ VGCC-PRE-TUN
 ### TunPossible_ctx: VGCC-PRE-TUN
 
 #### CheckVgccPreTun: contexting
-
 Qui controlliamo che ci siano le condizioni per aumentare o diminuire la quantita' di VGCC
-
 ```Gen
 CheckVgccPreTun: ( active: 60x )
   type: contexting
@@ -635,7 +620,6 @@ CheckVgccPreTun: ( active: 60x )
 ```
 
 #### PossibleUpPreVgccTun: accumulator
-
 ```Gen
 PossibleUpPreVgccTun: ( active: 10x )
   type: accumulator
@@ -648,7 +632,6 @@ PossibleUpPreVgccTun: ( active: 10x )
 ```
 
 #### PossibleDownPreVgccTun: accumulator
-
 ```Gen
 PossibleDownPreVgccTun: ( active: 10x )
   type: accumulator