diff --git a/neuron/presynapse.md b/neuron/presynapse.md index cfca155..be6ee20 100644 --- a/neuron/presynapse.md +++ b/neuron/presynapse.md @@ -228,8 +228,6 @@ PRESYNAPSE ### AP_ctx: PRESYNAPSE -#### NTreleaseLow: int: ms - Il rilascio di NT lo facciamo nel contesto di AP. Biologicamente dovrebbe avvenire solo in base alle concentrazioni, quindi anche al difuori degli AP. RF di interacting deve essere MOLTO piu' basso di un RF di AP. In maniera da essere attivo varie volte nel contesto di un episodio di AP. Il che ha senso perche' un AP e' SOMA ad un tempo piu' alto che i comportamenti di PRE. Questo poi per permettere la diversa contestualizzazione degli episodi di NTrelease, a piu' o meno alta velocita'. @@ -246,7 +244,7 @@ NT empty. Qui siamo contestualizzati se Ca2+ full, il che dovrebbe significare i In tutti i casi di NT -#### NTreleaseMedium: accumulator +#### NTreleaseLow: accumulator ```Gen NTreleaseLow: ( active: 12x ) # Low type: accumulator @@ -259,9 +257,6 @@ NTreleaseLow: ( active: 12x ) # Low ``` #### NTreleaseMedium: accumulatorv - -In tutti i casi di NT - ```Gen NTreleaseMedium: ( active: 9x ) # Medium type: accumulator @@ -276,7 +271,6 @@ NTreleaseMedium: ( active: 9x ) # Medium ``` #### NTreleaseHigh: accumulator - ```Gen NTreleaseHigh: ( active: 3x ) # High type: accumulator @@ -302,6 +296,7 @@ Serve a: --- +#### Ca2+TracesAccumulationLow: accumulator ```Gen Ca2+TracesAccumulationLow: ( active: 10x ) type: accumulator @@ -314,7 +309,6 @@ Ca2+TracesAccumulationLow: ( active: 10x ) ``` #### Ca2+TracesAccumulationMedium: accumulator - ```Gen Ca2+TracesAccumulationMedium: ( active: 6x ) # medium type: accumulator @@ -327,8 +321,6 @@ Ca2+TracesAccumulationMedium: ( active: 6x ) # medium ``` #### Ca2+TracesAccumulationHigh: accumulator - - ```Gen Ca2+TracesAccumulationHigh: ( active: 10x ) # high type: accumulator @@ -348,6 +340,7 @@ eCB dipende da POST. Tende a modulare l'entrata di Ca2+ degli VGCC. Qui non facciamo un flush di eCB, riduciamo ogni mezzo secondo (context) di un RF di questo episodio. +#### eCBClearance: accumulator ```Gen eCBClearance: ( active: 24x ) # Slow type: accumulator @@ -380,7 +373,7 @@ RPShuttleLow: ( active: 48x ) # Low trace: None ``` -#### RPShuttleMedium: accumulatorv +#### RPShuttleMedium: accumulator The "Sub-Optimal" State. The machinery is working, but it's held back by partial limitations. This covers cases where the signal is steady but the "piston" isn't firing at full speed, or where a high vacancy in the RRP (emptiness) forces a low signal to work a bit harder. @@ -494,8 +487,6 @@ VGCC-PRE Da rivedere le condizioni per aggiungere mGluR che ha come proxy NT concentration!!!!! -#### Ca2+enterLow: accumulator - Here we comprehend the breaking activity on VGCC by: CDI, eCB and mGluR: ![breaking-cases.png](.attachments/breaking-cases.png) @@ -514,6 +505,7 @@ Qui semplifichiamo: Devo controllare che le condizioni sotto siano esaustive. Qui ho confuso high con low, e inoltre ho messo NT per mGluR che devo controllare che abbia senso. +#### Ca2+enterLow: accumulator ```Gen Ca2+enterLow: ( active: 12x ) # Low type: accumulator @@ -526,7 +518,6 @@ Ca2+enterLow: ( active: 12x ) # Low ``` #### Ca2+enterMedium: accumulator - ```Gen Ca2+enterMedium: ( active: 6x ) # Medium type: accumulator @@ -541,7 +532,6 @@ Ca2+enterMedium: ( active: 6x ) # Medium ``` #### Ca2+enterHigh: accumulator - ```Gen Ca2+enterHigh: ( active: 3x ) # High type: accumulator @@ -556,8 +546,6 @@ Ca2+enterHigh: ( active: 3x ) # High ### NOT AP_ctx: VGCC-PRE -#### Ca2+ClearanceLow: accumulator - Qui eliminiamo Ca2+. Il tempo che ci mette ad eliminare il Ca2+ dovrebbe essere minoe dell'inervallo fra un AP_ctx e un'altra. Siccome non comprendiamo per ora ATP, non c'e' accumulo di Ca2+ per mancanza di ATP (stanchezza). Non non comprendiamo anche il ristabilimento del Voltage, con altri Ioni entranti e uscenti, per ora tutto dipende da AP del SOMA. Non comprendiamo per ora: @@ -570,6 +558,7 @@ Qui disinguiamo: - NOT ca2+ fullness che svuota piu' lentamente - da capire se serve veramente questa distinzione per il tempo di svuotamento. +#### Ca2+ClearanceLow: accumulator ```Gen Ca2+ClearanceLow: ( active: 24x ) # Low type: accumulator @@ -582,7 +571,6 @@ Ca2+ClearanceLow: ( active: 24x ) # Low ``` #### Ca2+ClearanceHigh: accumulator - ```Gen Ca2+ClearanceHigh: ( active: 4x ) # High type: accumulator @@ -595,7 +583,6 @@ Ca2+ClearanceHigh: ( active: 4x ) # High ``` ## VGCC-PRE-TUN: Tuner - ```Gen VGCC-PRE-TUN type: tuner @@ -618,9 +605,7 @@ VGCC-PRE-TUN ### TunPossible_ctx: VGCC-PRE-TUN #### CheckVgccPreTun: contexting - Qui controlliamo che ci siano le condizioni per aumentare o diminuire la quantita' di VGCC - ```Gen CheckVgccPreTun: ( active: 60x ) type: contexting @@ -635,7 +620,6 @@ CheckVgccPreTun: ( active: 60x ) ``` #### PossibleUpPreVgccTun: accumulator - ```Gen PossibleUpPreVgccTun: ( active: 10x ) type: accumulator @@ -648,7 +632,6 @@ PossibleUpPreVgccTun: ( active: 10x ) ``` #### PossibleDownPreVgccTun: accumulator - ```Gen PossibleDownPreVgccTun: ( active: 10x ) type: accumulator