organism/winnertakeall/BHE-WTA.md

BEH-WTA.md

BEH-WTA: Container

WTA Behavior: (directly observable, excluding TUN e DEV).

Questo e' il nuovo tipo di espansione che permette di specificare un "circuito" di possibilita'. A differenza di BD che espande PRE implicitamente e trattando PRE tutti allo stesso modo. L'espansione:

• dichiara N1 e N2
• dichiara AST1
• collega un N1 con un N2
• specifica che tipologia: excitation o inhibition
• specifica dove avviene la excitation o inhibition (SOMA, BDx, eventalmente AXOx)
• specifica il TUN che si occupera' della modulazione per CIASCUNA riga di espansione.

In questo modo abbiamo allargato il concetto di espansione. Problemi da risolvere:

• INH e EXH ora espongono il modulo WTA ad un'area cerebrale dove viene specificato l'intricazione fra moduli
• posso pensare di produrre il circuito in ambiente visuale tipo DrawIO, e avere un parser che me lo trasforma in questa sintassi.

---

How intrication_type resolves in circuit:

When parser sees:

NEU-001 -[EXH-001]-> NEU-003 ~AST-001

It looks up EXH-001:

EXH-001: N.AXO -[excites]-> N.BD-001 modulated_by: TUN-WTA-PRE-POST from TUN-WTA

And substitutes N with the actual neurons:

presynaptic: NEU-001.AXO postsynaptic: NEU-003.BD-001 type: excitatory astrocyte: AST-001 modulated_by: TUN-WTA.TUN-WTA-PRE-POST

---

container: BEH-WTA

 expansion:
 
  elements:
    NEU-001: N.md
    NEU-002: N.md
    NEU-003: N.md 
    NEU-004: N.md
    AST-001: AST.md
    AST-002: AST.md

  incoming:
    - INC-001 
    - INC-002 

  outgoing:
    - OUT-001
    - OUT-002

  expansion_template:
    - EXH-001: N.AXO -[exhites]-> N.BD-001 ~AST
        modulated_by: TUN-WTA-PRE-POST from TUN-WTA

    - EXH-002: N.AXO -[exhites]-> N.BD-002 ~AST
        modulated_by: TUN-WTA-PRE-POST from TUN-WTA

    - EXH-003: N.AXO -[exhites]-> N.BD-003 ~AST
        modulated_by: TUN-WTA-PRE-POST from TUN-WTA

    - INH-001: N.AXO -[inhibits]-> N.SOMA ~AST
        modulated_by: TUN-WTA-PRE-SOMA from TUN-WTA

  circuit:
    AREA-001:
      - NEU-001 -[EXH-001]-> NEU-003 ~AST-001
      - NEU-001 -[INH-001]-> NEU-003 ~AST-002

    AREA-002:
      - NEU-003 -[EXH-002]-> NEU-003 ~AST-001
      - NEU-004 -[EXH-003]-> NEU-003 ~AST-002

    AREA-003:
      - INC-001 -[INH-001]-> NEU-001 ~@
      - OUT-002 -[EXH-001]-> NEU-003 ~@

excitory: Expansion

expansion: excitory
  contained_by: BEH-WTA

    N.AXO -[excites]-> N.BD~@ ~AST

  

inhibitory: Expansion

expansion: inhibitory
  contained_by: BEH-WTA