diff --git a/neuron/presynapse.md b/neuron/presynapse.md index a4b5953..5f69b0b 100644 --- a/neuron/presynapse.md +++ b/neuron/presynapse.md @@ -41,7 +41,6 @@ Qui comprendiamo: --- **G expression**: - Qui riportiamo la struttura della espressione G e una descrizione di come leggerla (uno dei possibili modi): - i possibili behavior della presynapsi sono espressi in due contesti. AP_ctx and NOT AP_ctx. I possibili behavior sono anche raggrupati in ms, sec e min, per facilitarne la verifica. Quello che conta sono gli RF specifici di ciascuno snipplet. @@ -62,6 +61,48 @@ Qui riportiamo la struttura della espressione G e una descrizione di come legger - RPShuttle - RefillRPGlutamine (sec) +```Gen +PRESYNAPSE + AP_ctx + ms + NTreleaseLow: ( active: 12x ) # Low + NTreleaseMedium: ( active: 9x ) # Medium + NTreleaseHigh: ( active: 3x ) # High + Ca2+TracesAccumulationLow: ( active: 10x ) + Ca2+TracesAccumulationMedium: ( active: 6x ) # medium + Ca2+TracesAccumulationHigh: ( active: 10x ) # high + + NOT AP_ctx + sec + eCBClearance: ( active: 24x ) # Slow + RPShuttleLow: ( active: 48x ) # Low + RPShuttleMedium: ( active: 24x ) # Medium + RPShuttleHigh: ( active: 12x ) # Fast + Ca2+TracesClearance: ( active: 30x ) # Slow + + VGCC-PRE + AP_ctx + ms + Ca2+enterLow: ( active: 12x ) # Low + Ca2+enterMedium: ( active: 6x ) # Medium + Ca2+enterHigh: ( active: 3x ) # High + + NOT AP_ctx + ms + Ca2+ClearanceLow: ( active: 24x ) # Low + Ca2+ClearanceHigh: ( active: 4x ) # High + +VGCC-PRE-TUN + TunPossible_ctx + sec + CheckVgccPreTun: ( active: 60x ) + + TryTunUpPreVcgg_ctx + sec + PossibleUpPreVgccTun: ( active: 10x ) + PossibleDownPreVgccTun: ( active: 10x ) +``` + ## Presinapse I comportamenti sono episodi di integrazione di ipotesi, contestualizzati da condizioni. I comportamenti cambiano le condizioni e le condizioni influiscono sui comportamenti. Ma non in maniera causale, ma su contesti di tempi, spazi e quantita’ diversi. Gli sniplet di interacting sono quelli che determinano i comportamenti, quelli di contexting mettono constraints sulle condizioni. Le ipotesi fanno parte dei comportamenti, e sono concettualmente diverse dalle condizioni, perche’ si tratta di un accumulo di evidenza a seguito di ipotesi, evidenza che cambia le condizioni. @@ -158,7 +199,8 @@ Questo serve per il medio/lungo periodo --- ```Gen -container: PRESYNAPSE +PRESYNAPSE + type: container expansion: - VGCC-PRE ( full: 10x, active: 5x, empty: 2x )