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2026-03-16 11:06:41 +01:00
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commit c40b4a4342
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+34 -31
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@@ -8,13 +8,16 @@ Qui comprendiamo:
## BEH-AXO: Container
**Axon**: Axon does not contain specific behavior, here we comprehend it as a “cable” transporting the AP from SOMA to Presynapse. It expands BEH-PRE which can be Modulated (TUN).
**Axon**: Axon does not contain specific behavior, here we comprehend it as a “cable” transporting the AP from SOMA to Presynapse. It expands BEH-PRE which:
- can be developed by DEV-PRE
- the associations between BEH-PRE, BEH-POST e BEH-SYN is performed by the module that instantiate the Neurons and the Atrocytes, for example BEH-EXH or BEH-INH from winnertakeall.
```Gen
container: BEH-AXO
expansion: BEH-PRE ( fullness: 50x, active: 0x, emptiness: 10x )
# managed_by: BEH-WTA-PRE-POST from BEH-WTA
# managed_by: BEH-EXH or BEH-INH from winnertakeall
# developed_by: DEV-AXO-BEH-PRE-TUB from DEV-N
```
@@ -24,38 +27,38 @@ container: BEH-AXO
**Tubs:**
- Ca2+: Calcium Ion entering the Presynapse when VCGG open. They are key to check the concentration, release vescicles and modulation
- Rrp: Readily Releasable Pool
The Readily Releasable Pool consists of the vesicles that are "docked" and "primed" at the active zone of the synapse.
Location: Directly touching the presynaptic membrane.
Function: These are the first to be released when an action potential arrives.
Characteristics: This pool is very small (usually only about 0.5% to 5% of total vesicles) and can be exhausted quickly during high-frequency firing, leading to "short-term depression" of the signal.
- RecP: Recycling Pool
The Recycling Pool is the next line of reinforcement.
Location: Slightly further back from the membrane than the RRP.
Function: These vesicles maintain release during moderate, physiological levels of stimulation.
Characteristics: They are continuously refilled as the neuron "recycles" the membranes of used vesicles through endocytosis. This pool is larger than the RRP (roughly 5% to 20% of the total).
- Rp: The "Reserve Pool" (The true RP)
In many textbooks, RP specifically stands for the Reserve Pool.
Location: The bulk of the vesicles held further back in the terminal, often tethered by a protein called synapsin.
Function: These are only mobilized during intense, prolonged stimulation once the RRP and Recycling pools are depleted.
Characteristics: This makes up the vast majority of the vesicles (up to 80% or 90%).
- Nt: Neuro Transmitter, released in the synapse by the vescicles
- TagRelease: forse non serve, ma indica il rilascio di NT da parte di una syn.
- **Ca2+**: Calcium Ion entering the Presynapse when VCGG open. They are key to check the concentration, release vescicles and modulation
- **Rrp**: Readily Releasable Pool: The Readily Releasable Pool consists of the vesicles that are "docked" and "primed" at the active zone of the synapse.
-- Location: Directly touching the presynaptic membrane.
-- Function: These are the first to be released when an action potential arrives.
-- Characteristics: This pool is very small (usually only about 0.5% to 5% of total vesicles) and can be exhausted quickly during high-frequency firing, leading to "short-term depression" of the signal.
- **RecP**: Recycling Pool
--The Recycling Pool is the next line of reinforcement.
-- Location: Slightly further back from the membrane than the RRP.
-- Function: These vesicles maintain release during moderate, physiological levels of stimulation.
-- Characteristics: They are continuously refilled as the neuron "recycles" the membranes of used vesicles through endocytosis. This pool is larger than the RRP (roughly 5% to 20% of the total).
- **Rp**: The "Reserve Pool" (The true RP)
-- In many textbooks, RP specifically stands for the Reserve Pool.
-- Location: The bulk of the vesicles held further back in the terminal, often tethered by a protein called synapsin.
-- Function: These are only mobilized during intense, prolonged stimulation once the RRP and Recycling pools are depleted.
-- Characteristics: This makes up the vast majority of the vesicles (up to 80% or 90%).
- **Nt**: Neuro Transmitter, released in the synapse by the vescicles
- **CaTraces**: sono le tracce di permanenza della concentrazione di Ca2+. Servono alla modulazione (TUN)
- **TagRelease**: forse non serve, ma indica il rilascio di NT da parte di una Pre.
**Behaviors**:
L'idea e' che:
- Fast
-- i VCGG si aprano all'arrivo di un AP dal SOMA. Il numero dei VCGG presenti e' stato modulato (TUN) in una fase di non attivita' della presynapse
-- I VCGG fanno entrare Ca2+ che ne aumenta la concentrazione
-- ad un certo livello di concentrazione, viene liberata una vescica, se ci sono Rrp disponibili. La vescica libera xxx Nt nella sinsapsi
- Medium
-- clearance dei Ca2+ che depolarizza la Presinapsi
-- riciclo delle vesciche, prendendole dalla Sinapsi e mettenedole dentro a RecP
- Slow
-- riempimento vesciche di Nt e mettendole dentro Rp
-- spostamento da Rp a RecP
-- i VCGG si aprano all'arrivo di un AP dal SOMA. Il numero dei VCGG presenti e' stato modulato (TUN) in una fase di non attivita' della presynapse
-- I VCGG fanno entrare Ca2+ che ne aumenta la concentrazione
-- ad un certo livello di concentrazione, viene liberata una vescica, se ci sono Rrp disponibili. La vescica libera xxx Nt nella sinsapsi
- Medium timing
-- clearance dei Ca2+ che depolarizza la Presinapsi
-- riciclo delle vesciche, prendendole dalla Sinapsi e mettenedole dentro a RecP
- Slow Timing
-- riempimento vesciche di Nt e mettendole dentro Rp
-- spostamento da Rp a RecP
```Gen
container: BEH-PRE
@@ -80,14 +83,14 @@ container: BEH-PRE
tub_intricated:
```
### IntegrateCa2+: Context
### Ca2+Concentration: Context
Qui verifichiamo il livello di CA2+ nella presynapse. I comportamenti nella presinapsi dipendo tutti da questa concentrazione, sia quelli immediati di rilascio NT da vescicles che quelli di modulazione.
***Tens Milliseconds Time Scale***
```Gen
context: IntegrateCa2+
context: Ca2+Concentration
contained_by: BEH-PRE
in_context: Fixed
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@@ -2,7 +2,7 @@
**Neuron Behavior**: (directly observable, excluding TUN e DEV).
Questo container serve solo ad espandere AXO, SOMA e DB.
Questo container serve solo ad espandere AXO, SOMA e DB, ed ad essere attivato dallo scope DAY in N.md.
```Gen
container: BEH-N
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@@ -2,9 +2,9 @@
## N: Comprehension
**Neuron Comprehension**: Nel folder Appunti ci sono i comportamenti osservabili, dai quali siamo partiti, riducendone il numero per semplificare in questa prima fase. La forza della comprensione G. e' che possiamo aggiungere man mano nuovi comportamenti, senza gettare via nulla per ripartire da zero, come saremmo abligati a fare in una comprensione tradizionale.
**Neuron Comprehension**: Nel folder Appunti ci sono i comportamenti osservabili, dai quali siamo partiti, riducendone il numero per semplificare in questa prima fase. La forza della comprensione G. e' che possiamo aggiungere man mano nuovi comportamenti, senza gettare via nulla per ripartire da zero, come saremmo costretti a fare in una comprensione tradizionale.
In questa prima comprensione, cerchiamo di fare un'espressione la piu' semplice possibile.
In questa prima comprensione, cerchiamo di fare un'espressione la piu' semplice possibile per valutare la sintassi e la grammatica e l'enliving dell'espressione.
```Gen
comprehension: N
@@ -20,12 +20,12 @@ comprehension: N
# qui e' l'organismo che va a dormire (Ipotalamo)
```
### IntegrateBehTunDevPossibility: Context
### BehTunDevPossibility: Context
Alternanza BEH-N e TUN-N durante il giorno e DEV-N notte. Influenzata da intricazioni con lipotalamo che si occupa della fatica organismica. Lalternanza dei comportamenti in BEH-N e TUN-N, invece, e gestita in TUN-N.
Alternanza BEH-N e TUN-N durante il giorno e DEV-N notte. Influenzata da intricazioni con lipotalamo che si occupa della fatica organismica. Lalternanza dei comportamenti in BEH-N e TUN-N, invece, e gestita in TUN-N.
```Gen
scope: IntegrateBehTunDevPossibility
scope: BehTunDevPossibility
contained_by: N
in_context: Fixed