prima ristrutturazione. Ora c'e' distinzione fra comportamenti di DAY e NIGHT. IL TUN e' sparito, ciscun container ha il proprio Tuner se necessario.
This commit is contained in:
@@ -578,6 +578,58 @@ Gln — depletes over bursts, refilled by glucose (slowest, astrocyte-depend
|
||||
|
||||
Each tier buys time for the one below it to respond. When all three are depleted simultaneously — which only happens under prolonged high-frequency firing with insufficient glucose — the synapse has no remaining buffer and goes silent until the minutes loop restores the Glutamine_pool.
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||||
#### TUN-PRE-VGCC: Tuner
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||||
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||||
```Gen
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||||
Tuner: TUN-PRE-VGCC
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||||
contained_by: BEH-PRE
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||||
|
||||
tunes: BEH-PRE/expansion/BEH-PRE-VCGG
|
||||
|
||||
tub_modulation: # in TUN agiamo su POS/ACT
|
||||
- posMod ( fullness: None, active: BEH-PRE-VCGG/fullness, empty: 0x) # riferimento a possible di BEH-PRE-VCGG
|
||||
- actMod ( fullness: None, active: BEH-PRE-VCGG/active, empty: BEH-PRE-VCGG/emptiness) # riferimento a active di BEH-PRE-VCGG
|
||||
# qui stiamo modulando possible e actual di BEH-PRE-VCGG associandoli
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||||
# a posMod e actMod. Non serve associare una fullness perche'
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||||
# la modulazione e' una pompa fra posMod e actMod e controlliamo
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||||
# solo empty
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||||
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||||
context_intricated:
|
||||
- TunPossible ( contained_by: DAY-N )
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||||
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||||
tub_local:
|
||||
|
||||
tub_intricated:
|
||||
```
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||||
|
||||
##### Context
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||||
|
||||
```Gen
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||||
context: Check
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||||
contained_by: TUN-PRE-VGCC
|
||||
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||||
in_context: TunPossible
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition:
|
||||
out_context: TunPreVcgg
|
||||
```
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||||
|
||||
##### Episode
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||||
|
||||
```Gen
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||||
episode: Tun
|
||||
contained_by: TUN-PRE-VGCC
|
||||
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||||
in_context: TunPreVcgg
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||||
rf: ( active: x )
|
||||
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||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
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trace:
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```
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||||
## BEH-PRE-VGCC: Container
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||||
Voltage-Controlled Gated Channels: Qui per ora non gestiamo l'evoluzione della depolarizzazione. Alla scomparsa dell'AP, i VGCC smettono di funzionare.
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||||
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||||
@@ -1,19 +0,0 @@
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||||
# BEH-N: Container
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||||
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||||
**Neuron Behavior**: (directly observable, excluding TUN e DEV).
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||||
Questo container serve solo ad espandere AXO, SOMA e DB, ed ad essere attivato dallo scope DAY in N.md.
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||||
|
||||
```Gen
|
||||
container: BEH-N
|
||||
|
||||
include:
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||||
BEH-AXO.md
|
||||
BEH-SOMA.md
|
||||
BEH-BD.md
|
||||
|
||||
expansion:
|
||||
- BEH-AXO ( active: 1x )
|
||||
- BEH-SOMA ( active: 1x )
|
||||
- BEH-DB ( active: 3x )
|
||||
```
|
||||
@@ -313,6 +313,54 @@ Il clearance lo facciamo qui nel container dove creaiamo anche i VPost, perche'
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||||
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||||
### min: behaviors POST
|
||||
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||||
#### TUN-POST-AMPA: Tuner
|
||||
|
||||
```Gen
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||||
tuner: TUN-POST-AMPA
|
||||
|
||||
contained_by: BEH-POST
|
||||
|
||||
tunes: BEH-POST/expansion/BEH-POST-IC
|
||||
|
||||
tub_modulation: # in TUN agiamo su POS/ACT
|
||||
- posMod ( fullness: None, active: BEH-POST-IC/fullness, empty: 0x) # riferimento a possible di BEH-PRE
|
||||
- actMod ( fullness: None, active: BEH-POST-IC/active, empty: BEH-POST-IC/emptiness) # riferimento a active di BEH-PRE
|
||||
|
||||
context_intricated:
|
||||
- TunPossible ( contained_by: DAY-N )
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
|
||||
tub_intricated:
|
||||
```
|
||||
|
||||
##### Context
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
context: Check
|
||||
contained_by: TUN-POST-AMPA
|
||||
|
||||
in_context: TunPossible
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition:
|
||||
out_context: TunPostIc
|
||||
```
|
||||
|
||||
##### Episode
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
episode: ?
|
||||
contained_by: TUN-POST-AMPA
|
||||
|
||||
in_context: TunPostIc
|
||||
rf: ( active: x )
|
||||
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
trace:
|
||||
```
|
||||
|
||||
## BEH-POST-AMPA: Container
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
|
||||
@@ -210,6 +210,60 @@ episode: ClearVSOMA
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
trace:
|
||||
```
|
||||
|
||||
### sec: behaviors SOMA
|
||||
|
||||
### min: behaviors SOMA
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||||
|
||||
#### TUN-SOMA-VCGG: Tuner
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
tuner: TUN-SOMA-VCGG
|
||||
|
||||
contained_by: BEH-SOMA
|
||||
|
||||
tunes: BEH-SOMA/expansion/BEH-SOMA-VCGG
|
||||
|
||||
expansion: BEH-SOMA-VCGG
|
||||
tub_modulation: # in TUN agiamo su POS/ACT
|
||||
- posMod ( fullness: None, active: BEH-SOMA-VCGG/fullness, empty: 0x) # riferimento a possible di BEH-PRE
|
||||
- actMod ( fullness: None, active: BEH-SOMA-VCGG/active, empty: BEH-SOMA-VCGG/emptiness) # riferimento a active di BEH-PRE
|
||||
|
||||
context_intricated:
|
||||
- TunPossible ( contained_by: DAY-N )
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
|
||||
tub_intricated:
|
||||
```
|
||||
|
||||
##### Context
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
context: Check
|
||||
contained_by: TUN-SOMA-VCGG
|
||||
|
||||
in_context: TunPossible
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition:
|
||||
out_context: TunSomaVcgg
|
||||
```
|
||||
|
||||
##### Episode
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
episode: ?
|
||||
contained_by: TUN-PRE-VGCC
|
||||
|
||||
in_context: TunSomaVcgg
|
||||
rf: ( active: x )
|
||||
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
trace:
|
||||
```
|
||||
|
||||
## BEH-SOMA-VGSC: Container
|
||||
|
||||
|
||||
@@ -0,0 +1,28 @@
|
||||
# DAY-N: Container
|
||||
|
||||
**Neuron Behavior**: (traditionally observable, excluding Episodes Tuner).
|
||||
|
||||
Questo container serve solo ad espandere AXO, SOMA e DB, ed ad essere attivato dallo scope DAY in N.md.
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
container: DAY-N
|
||||
|
||||
expansion:
|
||||
- BEH-AXO ( active: 1x )
|
||||
- BEH-SOMA ( active: 1x )
|
||||
- BEH-DB ( active: 3x )
|
||||
```
|
||||
|
||||
## TunPossibility: Context
|
||||
|
||||
Qui controlliamo di essere lontani da uno spike train. Questo per eventualmente rendere possibili i tuning.
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
context: TunPossibility
|
||||
|
||||
contained_by: DAY-N
|
||||
in_context: Fixed
|
||||
rf: 60x
|
||||
|
||||
condition: ( SpikeTrainTraces Empty ) # Day
|
||||
out_context: TunPossible
|
||||
+10
-9
@@ -10,19 +10,21 @@ In questa prima comprensione, cerchiamo di fare un'espressione la piu' semplice
|
||||
comprehension: N
|
||||
|
||||
include:
|
||||
BEH-N.md
|
||||
TUN-N.md
|
||||
DEV-N.md
|
||||
DAY-N.md
|
||||
BEH-AXO.md
|
||||
BEH-SOMA.md
|
||||
BEH-BD.md
|
||||
NIGHT-N.md
|
||||
|
||||
expansion: BEH-N ( active: 1x )
|
||||
expansion: DAY-N ( active: 1x )
|
||||
|
||||
tub_intricated: DevPossible ( contained_by: BEH-ORG )
|
||||
tub_intricated: NightPossible ( contained_by: BEH-ORG )
|
||||
# qui e' l'organismo che va a dormire (Ipotalamo)
|
||||
```
|
||||
|
||||
### BehTunDevPossibility: Scope
|
||||
|
||||
Alternanza BEH-N e TUN-N durante il giorno e DEV-N notte. Influenzata da intricazioni con l’ipotalamo che si occupa della fatica organismica. L’alternanza dei comportamenti in BEH-N e TUN-N, invece, e’ gestita in TUN-N.
|
||||
Alternanza DAY-N durante il giorno e NIGHT-N notte. Influenzata da intricazioni con l’ipotalamo che si occupa della fatica organismica.
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
scope: BehTunDevPossibility
|
||||
@@ -32,9 +34,8 @@ scope: BehTunDevPossibility
|
||||
rf: 60x
|
||||
|
||||
condition: NOT ( DevPossible fullness ) # Day
|
||||
activate: BEH-N # la disattivazione e' la non attivazione
|
||||
activate: TUN-N
|
||||
activate: DAY-N # la disattivazione e' la non attivazione
|
||||
|
||||
condition: ( DevPossible fullness ) # Night
|
||||
activate: DEV-N
|
||||
activate: NIGHT-N
|
||||
```
|
||||
|
||||
@@ -1,4 +1,4 @@
|
||||
# DEV-N: Modulator
|
||||
# NIGHT-N: Modulator
|
||||
|
||||
Neuron Development - LTP-LTD Behavior:
|
||||
|
||||
-190
@@ -1,190 +0,0 @@
|
||||
# TUN-N: Modulator
|
||||
|
||||
**MTP-MTD Behavior**: Il TUN-N assieme a BEH-N sono entrambi attivi durante Day. TUN sente la stasi di BEH-N, quando e’ lontano da uno spiketrain, e contestualizza i comportamenti di TUN.
|
||||
|
||||
Il TUN contiene quei behavior di modulazione che non cambiano la somma (fullness + active). La modulazione TUN sposta da fullness a active e viceversa. Ovvero non c’e’ creazione di nuove “forma” di possibilita’. Nel caso di SYN, lo spostamento e’ da possible a “a disposizione” di SYN.
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
modulator: TUN-N
|
||||
contained_by: N
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
- SpikeTrainTraces (fullness: 50x, active: 0x, emptiness: 0x)
|
||||
# intricated with BEH-SOMA
|
||||
```
|
||||
|
||||
## TunPossibility: Context
|
||||
|
||||
Qui controlliamo di essere lontani da uno spike train. Siamo in Day con BEH.
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
context: TunPossibility
|
||||
|
||||
contained_by: TUN-N
|
||||
in_context: Fixed
|
||||
rf: 60x
|
||||
|
||||
condition: ( SpikeTrainTraces Empty ) # Day
|
||||
out_context: TunPossible
|
||||
```
|
||||
|
||||
## TUN-CHAN: Modulator
|
||||
|
||||
Qui si modulano i canali ionici, sia quelli voltage (PRE/POST/SO/altro?) che quelli Neuro (POST/SO(inibitori)). Non si creano o si distruggono (lo si fa in Developing), ma si rendono attivi disattivi quelli presenti.
|
||||
|
||||
> Minutes/hours Time Scale
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
modulator: TUN-CHAN
|
||||
|
||||
contained_by: TUN-N
|
||||
```
|
||||
|
||||
### TUN-PRE-VGCC: Modulator
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
modulator: TUN-PRE-VGCC
|
||||
|
||||
contained_by: TUN-CHAN
|
||||
|
||||
modulates: BEH-PRE/expansion/BEH-PRE-VCGG
|
||||
|
||||
tub_modulation: # in TUN agiamo su POS/ACT
|
||||
- posMod ( fullness: None, active: BEH-PRE-VCGG/fullness, empty: 0x) # riferimento a possible di BEH-PRE-VCGG
|
||||
- actMod ( fullness: None, active: BEH-PRE-VCGG/active, empty: BEH-PRE-VCGG/emptiness) # riferimento a active di BEH-PRE-VCGG
|
||||
# qui stiamo modulando possible e actual di BEH-PRE-VCGG associandoli
|
||||
# a posMod e actMod. Non serve associare una fullness perche'
|
||||
# la modulazione e' una pompa fra posMod e actMod e controlliamo
|
||||
# solo empty
|
||||
|
||||
context_intricated:
|
||||
- TunPossible ( contained_by: TUN-N )
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
|
||||
tub_intricated:
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### Context
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
context: Check
|
||||
contained_by: TUN-PRE-VGCC
|
||||
|
||||
in_context: TunPossible
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition:
|
||||
out_context: TunPreVcgg
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### Episode
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
episode: Tun
|
||||
contained_by: TUN-PRE-VGCC
|
||||
|
||||
in_context: TunPreVcgg
|
||||
rf: ( active: x )
|
||||
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
trace:
|
||||
```
|
||||
|
||||
### TUN-POST-AMPA: Modulator
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
modulator: TUN-POST-AMPA
|
||||
|
||||
contained_by: TUN-CHAN
|
||||
|
||||
modulates: BEH-POST/expansion/BEH-POST-IC
|
||||
|
||||
tub_modulation: # in TUN agiamo su POS/ACT
|
||||
- posMod ( fullness: None, active: BEH-POST-IC/fullness, empty: 0x) # riferimento a possible di BEH-PRE
|
||||
- actMod ( fullness: None, active: BEH-POST-IC/active, empty: BEH-POST-IC/emptiness) # riferimento a active di BEH-PRE
|
||||
|
||||
context_intricated:
|
||||
- TunPossible ( contained_by: TUN-N )
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
|
||||
tub_intricated:
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### Context
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
context: Check
|
||||
contained_by: TUN-POST-IC
|
||||
|
||||
in_context: TunPossible
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition:
|
||||
out_context: TunPostIc
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### Episode
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
episode: ?
|
||||
contained_by: TUN-POST-IC
|
||||
|
||||
in_context: TunPostIc
|
||||
rf: ( active: x )
|
||||
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
trace:
|
||||
```
|
||||
|
||||
### TUN-SOMA-VCGG: Modulator
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
modulator: TUN-SOMA-VCGG
|
||||
|
||||
contained_by: TUN-CHAN
|
||||
|
||||
modulates: BEH-SOMA/expansion/BEH-SOMA-VCGG
|
||||
|
||||
expansion: BEH-SOMA-VCGG
|
||||
tub_modulation: # in TUN agiamo su POS/ACT
|
||||
- posMod ( fullness: None, active: BEH-SOMA-VCGG/fullness, empty: 0x) # riferimento a possible di BEH-PRE
|
||||
- actMod ( fullness: None, active: BEH-SOMA-VCGG/active, empty: BEH-SOMA-VCGG/emptiness) # riferimento a active di BEH-PRE
|
||||
|
||||
context_intricated:
|
||||
- TunPossible ( contained_by: TUN-N )
|
||||
|
||||
tub_local:
|
||||
|
||||
tub_intricated:
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### Context
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
context: Check
|
||||
contained_by: TUN-SOMA-VCGG
|
||||
|
||||
in_context: TunPossible
|
||||
rf: ( active: 60x )
|
||||
|
||||
condition:
|
||||
out_context: TunSomaVcgg
|
||||
```
|
||||
|
||||
#### Episode
|
||||
|
||||
```Gen
|
||||
episode: ?
|
||||
contained_by: TUN-PRE-VGCC
|
||||
|
||||
in_context: TunSomaVcgg
|
||||
rf: ( active: x )
|
||||
|
||||
hypothesis:
|
||||
action:
|
||||
trace:
|
||||
```
|
||||
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